775.反制措施(2 / 7)

最终诊断 号西风 4595 字 5个月前

任何系统治疗之前,都会将符合条件的组织和外周血液样本进行匹配。此外,我们还收集了另外16份手术样本和5例仅有brms的肺腺癌患者的配对外周血液,并对其进行了测序。我们的目标包括:(1)确定肺腺癌的lim和brm在其原发瘤的单核苷酸变异(snv)和拷贝数变异(cnv)方面是否有不同的突变景观;(2)比较lim和brm的进化模式;(3)表征brm的转移内和转移间的异质性。

最典型的突变驱动基因包括28例(%)样本中的tp53(15例/23例)和12例(%)样本中的egfr突变(6例/23例)(图1a)。值得注意的是,tp53和egfr突变在匹配的原发肿瘤和转移肿瘤之间高度一致。

为了研究肿瘤间的异质性,已识别的基因改变被分类为共享的(存在于原发和转移肿瘤中)或私有的(仅存在于原发和转移的肿瘤中)突变。23我们观察到lim队列中肿瘤间的同质性明显更高,被鉴定为共享的基因突变的中位数为%(范围为%-%)。这与brm队列中发现的%(范围为%-%)共享基因突变的中位数形成鲜明对比。

lim-p和lim-m之间的tmb相似(p>)。

然后,我们利用皮尔逊相关分析计算突变相似度,以描述配对的原发肿瘤和转移肿瘤之间突变特征的一致性和差异性。如图1e和1f所示,我们观察到lim组lim-p和lim-m之间的突变一致性较高,而brm组brm-p和brm-m之间的突变一致性有限。统计分析表明,lim组突变相似性的皮尔逊相关系数显著高于brm组(p=)。

我们用皮尔逊相关分析研究了配对的原发瘤和转移瘤之间cnv分布的不一致性。结果显示,lim-p和lim-m之间的cnv模式高度相似,10例中有9例(%)的pearson相关系数大于。然而,配对的brm-p和brm-m之间的