来到京城，朱由检才发现李起元是真的有病，无力承担重任。

这让他慌得急忙把李起元转为资政大臣休养，免得被诟病累死老臣。

还有八十三岁的长城督师王象乾，眼看起复时间就要满一年。朱由检是不敢再留任，甚至担心他在最后这几个月身体出问题。时常派太监慰问，甚至派太医跟随。

陈奇瑜身为不到四十的年轻人，就这样被加了担子。在秦士文休养的时候，署理太仆寺卿和兵部右侍郎。