果是数千吨的战列舰，上桅之上还会有顶桅，长水号大小的船只则不需要。各桅上都有用来张挂横帆的横桁。

陈守序在这里做的改良是，将前桅和主桅的主帆由底桁帆换成了中桁帆。因为越靠近海面的风越容易产生乱流，高处的风向更稳定。但上桁如果作为主帆船只的重心就又太高了，所以中桁帆是比较好的选择。而且因为陈守序习惯了暴风号的迅疾，为了给长水号增加顺风的航速，他在前、主桅的底、中桁向两侧分别增加了可收放的翼帆。

后桅则像暴风号一样，将三角帆更换成斜桁帆，后桅的横帆只有上、中桁帆，无须更改。

桅杆之间，为了辅助操船，陈守序增加了多面纵帆。其中首斜桅张挂三面支索帆，主桅与前桅之间两面支索帆，主桅与后桅之间一面支索帆。

长水号的船舵系统依然与此时的其它船只一样，使用舵杆操纵，没有舵轮。舵杆延伸至后甲板的艉楼内，操舵在后甲板进行。舵的单侧转向幅度只有7度，因此船只的转向必须依靠船帆的辅助。

整艘船的帆装堪称武装到了牙齿，领先欧洲半个世纪以上。但代价就是整艘船的帆索系统十分复杂，需要很多人手。

长水号从最高处开始，依次是艉楼甲板，露天的前甲板与后甲板，上甲板，下甲板和货舱，共5层。

艉楼甲板露天，承重结构较弱，只是在舷墙上布设了4门回旋炮。艉楼甲板是军官舱室的屋顶，陈守序给个人留的空间并不大，他拆除了部分原有的艉楼。剩下的尾舱被他隔开分成了两部分，船长室占据了小的那部分，沿着船纵向摆下一床，剩余为一桌，一柜足矣。大的部分则是军官的宿舍，比陈守序的房间多出的是在尾舱中央有一张圆桌。这张圆桌其实是船舵的舵轴顶盖。体现出军官待遇的是在尾舱两侧分别有两个军官厕所，对陈守序来说这是他这么长时间以来第一次享有独立卫生间。

艉楼甲板之下是后甲板，后甲板与前甲板