附近的战争做了一番了解。
早在巴达维亚建城之前,1600年诺尔特率领两艘战舰,莫里斯号与协和号,在菲律宾掳掠往来的商船,西班牙人立即武装了两艘马尼拉大帆船,由副总督法学博士莫尔加率领,迎战荷兰人。马尼拉大帆船因为需要超载走私,普遍吨位大,装载力强。当马尼拉大帆船不需要装载货物,将重炮装上船,在东南亚就是强大的战舰。荷兰人的舰队刚刚经过跨洋航行,状态很不好。诺尔特也是倒霉,本来他的舰队有四艘战舰,但在跨洋航行中损失了两艘。结果西班牙人在海战中接舷成功,圣巴托洛梅号俘虏了协和号。圣地亚哥号上的西班牙的海上步兵也登上了旗舰莫里斯号,荷兰人差点全跪了。但诺尔特在甲板失守后,在舱内点火,装作要点燃弹药库与西班牙人同归于尽,这才把西班牙人逼退。然后荷兰人抓住机会逆袭,在近距离的炮击中击沉圣地亚哥号。
1609年,又一只荷兰舰队封锁了马尼拉港。但因为圣地亚哥堡的存在,荷兰人也无法攻进港内。时任菲律宾都督狂热地准备战争,在封锁的这段时间内,西班牙人拼命铸造大炮,将大帆船改装成战舰,然后都督亲率六艘战舰进攻锚泊的荷兰舰队。第一次杭达滩海战爆发,荷兰舰队司令战死,五艘战舰被西班牙人击沉、俘虏了四艘,只剩一艘逃走。
到了1616年,荷兰人再次出动舰队,不过这次他们没有直接攻击马尼拉,而是找上了苏禄人。荷兰与苏禄的联合舰队席卷了怡朗和比萨扬人的港口,掳走无数奴隶。荷兰人在香料群岛的种植园对奴隶的需求很大。就是这次作战,让苏禄与巴达维亚建立了盟友关系。
一年后,1617年,荷兰再次出动10艘舰队直扑马尼拉,第二次杭达滩海战爆发。西班牙马尼拉都督出动11艘战舰迎战,战斗持续了两天。荷兰舰队旗舰被西班牙人俘虏,两艘战舰被击沉,又是一次大败。
1624年,荷兰再次扑向马尼拉。与