意不肯听从，在万般无奈的情况下。张之洞联合其余几位参政，借执政李鸿章病重之机逮捕囚禁了孙纲。并接受了美国总统罗斯福的调停。准备迅同俄国达成和解，结束战争。而张之洞的想要迅结束战争囚禁孙纲的行为激怒了中**方和一些掌握实权的中国官员，他们联合起来动了一场政变，使军方的最高领导者孙纲重新上台，依靠军队掌握了政权的孙纲随即迫使张之洞及其余几个参政交出权力，退出中国政坛。而张之洞不久病身亡。而种种迹象表明，张之洞是被孙纲的部下（也极有可能是孙纲本人直接命令的）下毒杀死。

这种观点的主要论据是张之洞给当时在美国朴茨茅斯同俄国谈判的中国外交使团去的电报，在电报中，张之洞要求中国代表团迅同俄国达成和约，并指示中国代表向俄国让步，中国放弃对俄国东西伯利亚地区的领土要求以及赔款。只要求将两国疆界恢复到时，为此中**队将撤出赤塔和尼布楚。这个条件对俄国来说是相当有利的，如果不是张之洞急于结束战争，他是不会敢冒天下之大不韪而提出来这个被后人称为“俄国不胜而胜，中国不败而败”的条件的。

另外一个论据是，张之洞上台后直接宣布解除孙纲的军职，而后孙，纲本人及其家人同外界的联系全部断绝，连一些进京述职的军官都无法见到，而当时孙纲的重要部下之一华夏共和国安全署署长任厚泽也突然失踪，就证明他们其实已经被张之洞囚禁，随后华夏共和国的一系列政令都出自张之洞和刘坤一等几位参政之手就更说明了这一点。

而后来张之洞的突然神秘去世也说明，很有可能是孙纲在反击成功后对张之洞下了毒手。

据一些书中称，张之洞去世前曾食用汤圆，食后不久即难受呕吐，左右以西洋解毒剂合绿豆汤服之，状况稍解，而当夜突又作，救之不及，顷刻即死，且死后两眼赤。全身布满红斑，尸体又很快腐烂。这说明张之洞是中毒身亡的，而后来的官方公布称死