勋贵的商议，朱慈烺正式改左军都督府、右军都督府、前军都督府、后军都督府为东军都督府，西军都督府，南军都督府，北军都督府。

加上不变的中军都督府，五军都督府重置，管辖的地方亦做出变动。

中军都督府，领导指挥直隶、浙江、福建境内所有武装力量，设都督府于直隶南京，由天武三军戍卫直隶，。

东军都督府，领导指挥湖广、河南、江西境内所有武装力量，设都督府于湖广武昌，由安武军驻扎。

南军都督府，领导指挥广东、广西、云南、贵州境内所有武装力量，设都督府于云南昆明，由靖武军驻扎。

西军都督府，领导指挥陕西、四川境内所有武装力量，设都督府于陕西西安，由定西军驻扎。

北军都督府，领导指挥北直隶、山东、山西、大宁境内所有武装力量，设都督府于北直隶北京，由天雄军驻扎。

新的五军都督府，既负责守土边疆，又负责攻略四方，如同五大战区.....

中军都督府，攻略东番、南洋、清国、日本、澳洲，范围是整个南海、东海、太平洋，往美洲发展。

南军都督府，攻略东南亚诸国、印度等地。

北军都督府，攻略漠北，配合征北都护府和征东都护府，攻略清国和西伯利亚，范围到北冰洋。

西军都督府，攻略漠西蒙古，准格尔汗国、叶尔羌汗国、和硕特汗国等，范围到中亚。

东军都督府，负责补位机动，哪方有战事便出兵助攻。

为了调动将士开疆拓土的积极性，朱慈烺实行领地封邑制，只要军功卓著，为大明开疆拓土者，皆可赏赐领土，给予土地使用权。

比如，周遇吉如果能打下漠西一个汗国，为大明开疆拓土百万平方公里，将会得到一县之地的领地，拥有领地内所有土地使用权、经济自主权、人事任免权。

在缴纳赋税和尽其他义务的条件下，周遇吉的子孙后