微液滴包含一个独特的分子标识符(umi),用于对单细胞内的微转录材料进行条形码。根据每个细胞的umi,即使细胞被裂解,在后续的分析中也可以找到转录信息。基于这一特点,10xgenomicschromium平台同时测序数千个细胞。与smart-seq2等低通量方法相比,10xgenomicschromium平台因其成本低、效率高而被更广泛地应用于b细胞检测。
在对多种scrna-seq方法的比较研究中,10xgenomics也比其他高通量方法如drop-seq和indrops[33]具有更高的灵敏度,更高的与线粒体基因匹配的reads比例,更低的噪声。利用10xgenomics和smart-seq2平台,可以通过不同的免疫球蛋白重链特征区分crc中b细胞的亚群,聚类结果无明显差异。但是,10xgenomics也有不足之处,它不能覆盖所有的基因,并且存在3区域偏倚,在检测基因突变或mrna剪接位点时可能会遗漏一些重要信息。此外,这种方法对细胞质量有更高的要求,不同的组织和不同的获取样本的方法都不同。利用scrna-seq,我们可以更精确地定义细胞的亚型,追踪它们的发育谱系,确定克隆型和表现型之间的关系,绘制不同细胞之间的相互作用和空间关系图,从而从多个维度描述tme。此外,还需要通过一系列体内和体外实验来验证结果。我们总结了使用scrna-seq研究的最新出版物
b细胞受体(bcellreceptor,bcr)是一种能识别并结合特异性抗原的膜免疫球蛋白,在b细胞的分化成熟过程中起着重要作用。bcr由两条重链和两条轻链组成,其中可变(v)、多样性(d)和连接(j)基因序列的重组创造了b细胞的多样性。这种多基因的复杂性使得鉴别不同的受体变得困难。然而,由于每个b细胞通常表达一个单一的