止士兵烧杀抢掠。英国人还在公告中称这次攻打广州城，要归责于叶名琛，叶名琛不愿意谈判所导致。英法联军入城后不会骚扰商户和居民，谈判、军事都与商民无关，大家安心生活。

稍后，广州将军穆克德讷和广东巡抚柏贵会同署名贴出安民告示，称和洋人和议可定，城内士民毋惊恐，大家安心生活，商户正常营业。

见英国人到处搜捕叶名琛，叶名琛的家丁便将叶名琛转移到左都统衙门。

英法联军将两广总督府中财物一掠而空，并将广东布政司库银二十万两全部取走。

然后又将南海县大狱里的囚犯释放，作为向导分到各小队，帮助搜捕叶名琛。

这边搜查叶名琛未果，英法联军将已被软禁的广州将军穆克德讷和广东巡抚柏贵带到观音山议事，要在广州建立临时的管理机构。

英法联军建立了“联军委员会”，对广州进行占领并实施殖民统治。这个委员会设在广东巡抚衙门里，由英国领事巴夏礼、英军上校哈罗威和法军大佐修莱掌控。他们扶植广东巡抚柏贵为傀儡，通过柏贵执行他们的意志。

身在巡抚衙门，柏贵没有任何自由可言。衙门内外，均有英法士兵把守，柏贵能见谁、不能见谁，自己没有决定权。他所发布的告示文件，须由巴夏礼等批准，咸丰皇帝谕旨也被巴夏礼等截取。实际上，以柏贵为首的广东巡抚衙门成为中国近代史上第一个地方傀儡政权。

1858年1月5日，占领广州数天后，联军继续逐一搜查各个衙门。叶名琛尚在左副都统署的第五院，当联军还搜查第一院时，家丁劝叶名琛逃亡，叶名琛不肯逃。

等联军搜到第五院，发现了叶名琛，叶名琛已经做好被抓的准备，已经整整齐齐的将官服和顶戴花翎穿戴好。

真抓到了叶名琛，英国人发现其实这是个烫手山芋，叶名琛又不投降，又不能处死，放在广州又怕人劫狱，考虑到香港和新加坡也华人众多，干